روش پژوهش دانش آموزی در کلاس دوم و سوم یکسان است. در این مرحله، پژوهش مشاهده، پرسش (طرح سوال)، سنجش سوال اولیه یا آزمایش در برابر پاسخ احتمالی که در ذهن کودک ایجاد می شود (فرضیه)، یادداشت کردن و گزارش برآیند کار(نتیجه ی پژوهش) را در برمی گیرد.
