موسسه مادران امروز دارای ۲کتابخانه است: کتابخانه تحقیقاتی و کتابخانه امانی.کتابخانه تحقیقاتی موسسه مدت ها قبل از شروع کار موسسه مادران امروز به وجود آمده است و از زمان تاسیس موسسه یعنی از سال ۱۳۷۷به موسسه منتقل شده است. این کتابخانه شامل بخش‌های ادبیات کودک و نوجوان، کتاب‌های روانشناسی و تربیتی است. در بخش ادبیات کودک حدود ۵۰۰۰ جلد کتاب دارد. این بخش شامل کتاب‌های منتشر شده از سال ۱۳۳۰ است.
تعداد کتاب‌های روانشناسی و تربیتی حدود ۲۰۰۰ جلد است. کارشناسان موسسه و دانشجویان با هماهنگی قبلی می‌توانند از این کتابخانه استفاده کنند. طبقه‌بندی کتاب‌ها در این کتابخانه بر اساس رده‌بندی دیویی است. اطلاعات کتابخانه با یک برنامه‌ی نرم افزاری کامپیوتری در شبکه‌ی داخلی موسسه قابل دسترسی است.
كتابخانه‌ی امانی نام كتابخانه‌ای است در موسسه مادران امروز كه از سال ۱۳۸۰ به اعضای خود كتاب امانت مي دهد.هدف از تشکيل کتابخانه ی امانی در موسسه ترويج فرهنگ مطالعه در بين خانواده ها وايجاد سهولت در دسترسی به كتاب های مورد نياز مادران عضو موسسه است.
موضوع كتاب‌ها در زمينه های تعليم و تربيت، روانشناسی، ادبيات كودك، ادبيات بزرگسال و علمی است.
